docxファイルをLibreOffice(4.3.7.2)で開いたところルビ文字のふりがなが親の漢字ごと消えていました。
検索してみると、
https://bugs.documentfoundation.org/show_bug.cgi?id=50607
docであれば大丈夫みたいです。

OpenXMLのルビまわり

<w:ruby>...</w:ruby>

http://bit.ly/1eefSdL

オートコレクトを無効にする

文章中でハイフンと右向き(不等号) -> を使うことがあるのですが、LibreOfficeのWriterでこの文字を入力すると、自動的に右向き矢印 → に変換されてしまいます。

自動変換（オートコレクト）をさせたくない場合は、

書式 -> オートコレクト -> 入力時
を開いてチェックを外します。